Открытый доступ Открытый доступ  Ограниченный доступ Платный доступ или доступ для подписчиков

Особенности генетической структуры трех популяций лососевых рыб, используемых в рыбном хозяйстве

Валентина Ивановна Тыщенко, Валерий Павлович Терлецкий

Аннотация


Рассмотрен полиморфизм анонимных фрагментов ДНК в геноме 3 групп радужной форели, отличающихся по окраске — Альбино, Паломино и Янтарная дикой окраски. Фрагменты ДНК выявляли методом RAPD-PCR с использованием 10 праймеров. Показано, что праймеры значительно отличаются по своей дискриминационной способности, и лучшие результаты можно получить при одновременном использовании многих праймеров. Предложенный подход с использованием суммарной матрицы по всем 10 праймерам позволяет достичь лучших результатов генотипирования. Наибольшее число выявляемых фрагментов ДНК обеспечил праймер OPA-16. Некоторые фрагменты ДНК были практически мономорфными, т.е. встречались почти у всех рыб 3 групп. Многие праймеры позволили идентифицировать фрагменты, встречающиеся у одной группы с высокой частотой, а у другой — с низкой. Праймер UBC-509 обеспечил максимальное число выявляемых генетических локусов, достигающее 13,79 у рыб Янтарной дикой окраски. Данный праймер уступал праймерам OPA-16 и OPC-12 по числу детектируемых фрагментов ДНК, однако локусы имели достаточно высокий полиморфизм. Наибольшее генетическое расстояние отмечалось между группами Альбино и Янтарная дикой окраски (D = 0,0067). Внутрипопуляционное генетическое разнообразие рассчитывали по критерию средней гетерозиготности для каждого праймера в отдельности и по суммарной матрице. Группы Альбино и Паломино не отличаются друг от друга по уровню внутрипопуляционного разнообразия, а группа Янтарная дикой окраски характеризуется пониженным генетическим разнообразием.

Ключевые слова


радужная форель; ПЦР; полиморфизм; геномная ДНК; фенотипическая вариация

Полный текст:

PDF

Литература


Кирпичников В. С. Генетика и селекция рыб. — М.: Наука, Ленинградское отд., 1987. С. 21 – 34.

Neissi A., Rafiee G., Farahmand H., et al. Cold-resistant heterotrophic ammonium and nitrite-removing bacteria improve aquaculture conditions of Rainbow Trout (Oncorhynchus mykiss) / Microbiol. Ecol. 2020. V. 80. No. 2. P. 266 – 277. DOI: 10.1007/s00248-020-01498-6.

Yavuzcan Y. H., Robaina L., Pirhonen J., et al. Fish welfare in aquaponic systems: its relation to water quality with an emphasis on feed and faeces — a review / Water. 2017. V. 9. P. 13.

Боровик Е. А. Радужная форель. — Минск: Наука и техника, 2019. С. 45 – 54.

Yáñez J. M., Newman S., Houston R. D. Genomics in aquaculture to better understand species biology and accelerate genetic progress / Front. Genet. 2015. V. 6. P. 128. DOI: 10.3389/fgene.2015.00128.

Животовский Л. А. Генетическая история лососевых рыб рода Oncorhynchus / Генетика. 2015. Т. 51. № 5. С. 584 – 599. DOI: 10.7868/S0016675815050100.

Kiselyova T. Y., Terletsky V. P., Kantanen J., et al. Linkage disequilibrium analysis for microsatellite loci in six cattle breeds / Rus. J. Genet. 2014. V. 50. No. 4. P. 406 – 414.

Terletski V., Schwarz S., Carnwath J., et al. Subtracted restriction fingerprinting — a tool for bacterial genome typing / BioTechniques. 2003. V. 34. No. 2. P. 304 – 313.

Terletsky V. P., Tyshchenko V. I., Novikova I. I., et al. An efficient method for genetic certification of Bacillus subtilis strains, prospective producers of biopreparations / Microbiology. 2016. V. 85. No. 1. P. 71 – 76. DOI: 10.7868/S0026365616010134.

Шайхаев Е. Г., Животовский Л. А. Эволюция микросателлитных локусов лососевых рыб / Генетика. 2014. Т. 50. № 8. С. 967 – 974. DOI: 10.7868/S0016675814080074.

Stephens J. C., Gilbert D. A., Yuhki N., et al. Estimation of heterozygosity for single-probe multilocus DNA fingerprints / Mol. Biol. Evol. 1992. V. 9. P. 729 – 743.




DOI: https://doi.org/10.30906/1999-5636-2022-12-28-33

Ссылки

  • На текущий момент ссылки отсутствуют.


Наши партнеры:



    

 

Подписаться на наши издания Вы можете через почтовые каталоги агентства «Роспечать» и Объединенный каталог «Пресса России»а также на сайтах агентств «УП Урал Пресс», «Информнаука»«Прессинформ» и «Профиздат».

© Издательский дом «Фолиум», 1998–2023